Pendidikan formal pertama di tanah Papua dimulai pada Tahun 1857 di Mansinam Manokwari. Gedung sekolahnya hanya menggunakan sebuah bilik/kamar dalam rumah keluarga Pdt. Ottow. Guru pertama dan satu-satunya guru dikala itu adalah Ny. Ottow. Mata pelajaran yang diajarkan dalam pendidikan awal di Tanah Papua oleh Ny. Ottow adalah :

1. Bagaimana berkebun

2. Bagaimana bercocok tanam

3. Ketrampilan / pekerjaan tangan

4. Kesehatan ( bagaimana hidup sehat )

5. Membaca

6. Menulis

7. Berhitung

8. Menyanyi

9. Berdoa

Sekolah Kristen pertama didirikan di tanah Papua 2 tahun kemudian setelah pendaratan 2 penginjil pertama dari Jerman. Pendidikan atau Sekolah Kristen ini didirikan adalah untuk mewujudnyatakan amanat Yesus, yatu menjadikan semua bangsa muridNya. Dengan demikian amanat Pekabaran Injil ( PI ) yang dibawa oleh kedua Penginjil dari Jerman ini juga adalah dalam rangka menjadikan manusia menjadi murid Yesus Kristus.

Itulah sebabnya, satu-satunya cara untuk mewujudkan Misi ini adalah melalui “ Pendidikan dan Pengajaran”. Tujuan mengajar dan mendidik adalah supaya murid itu ( manusia ) berkualitas untuk melakukan perintah Yesus melalui kata, sikap dan tindakan. Karena pembaptisan dalam pekabaran Injil tidak dapat dipisahkan dari tugas untuk mengajar dan mendidik.

Dalam perkembangan Pekabaran Injil oleh Badan Zending di tanah Papua 101 Tahun kemudian lahirlah sebuah lembaga keagamaan di negeri ini “ Gereja Kristen Injili ( GKI ) di Tanah Papua, 26 Oktober 1956 dan setelah 6 tahun GKI berdiri, dibentuklah sebuah lembaga pendidikan tertua di tanah Papua ; “ Yayasan Pendidikan Kristen ( YPK ), yang telah membentuk SDM Papua yang selanjutnya telah tampil memimpin pemerintahan di tanah Papua yang dibentuk oleh Pemerintah RI melalui Undang-undang Nomor 12 Tahun 1969 tentang Pembentukan Pemerintah Provinsi Irian Barat dan 9 Kabupaten.

Barang Siapa bekerja dengan jujur di negeri ini, ia akan melihat tanda heran yang satu ke tanda heran yang lainnya ( I. S. Kijne ) dan inilah wujud tanda heran itu, ketika Pekabaran Injil, 5 Februari 1855, lalu 2 tahun kemudian ada sekolah Kristen 1857, hasilnya orang-orang Papua pertama dibaptis, Petrus Kafiar menjadi Penginjil sebagai buah Injil mula-mula, GKI berdiri 1956 ( 101 tahun setelah PI), YPK lahir 1962 ( 107 tahun kemudian ) mempersiapkan SDM Papua, satu provinsi dan sembilan kabupaten di Irian Barat dibentuk ( 114 tahun kemudian ), orang-orang Papua sendiri memimpin negerinya, berdiri lagi provinsi kedua di tanah Papua ( 148 tahun kemudian setelah PI, 11-11-2003 ) dan masih banyak lagi yang belum disebutkan di sini.